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……바닥에는 남자의 시체가 뒹굴고 있었다. ……우리는 이 시체의 제1발견자이자, 동시에 범인의 가장 유력한 후보이기도 했다. 어느 맨션의 한 방. 아카리와 아오이가 눈을 뜨자, 눈앞에는 조금 전까지 이야기를 나누던 남자의 시체가 뒹굴고 있었다. 자욱한 담배 연기가 일렁이는 기괴한 현장에서 두 사람은 진상을 찾아낼 수 있을 것인가…….
이 거리에는, 어느 마피아 패밀리가 존재했다――. 「Rovina Family」라는 이름을 내건 그 조직은, 약 15년에 걸쳐 이 거리에 거점을 두고 온갖 악행을 저질러 왔다. 도시 전체를 휘말리게 한 대량 학살 테러를 시작으로, 마약과 무기 밀매·고문·살인에 이르기까지 무엇이든 저지르며 사람들을 공포에 빠뜨리고, 때로는 혐오의 대상이 되는 거대한 악의 조직. 하지만 실상은, 최근 몇 년 사이 조직의 거대화에 따른 내부 항쟁의 격화로 고통받고 있었다. 항쟁은, 창시자인 보스를 중심으로 해야 한다고 보는 「보스파」와, 보스의 방침에 이의를 제기하는 간부들을 중심으로 한 「혁신파」가 충돌하며, 조직 내부 정치에 그치지 않고 거리에서의 이권 다툼까지 번져, 이제는 같은 조직이라고는 생각할 수 없을 정도로 격렬한 싸움을 벌이고 있다. 과격화되는 「혁신파」의 칼날은, 이제 조직의 수장인 보스 본인에게까지 향하고 있었다. 보스는 아지트가 아닌 산속 깊은 곳에 있는 자신의 저택으로 몸을 숨기게 된다. 그 저택에는 보스가 허락한 사람 외에는 출입할 수 없다. ――어느 날, 그 저택에서. 이게 무슨 일인가, 보스가 죽었다. 살해당했다. 도대체 누가? 「혁신파」의 스파이가 숨어든 것인가, 아니면――.

────때는, 현대. 수많은 신들은 자유롭게 저마다의 삶을 만끽하고 있었다. 그런 신들이 한자리에 모이는 것은 10년에 한 번 열리는 【신계재판】의 날뿐이다. 신계재판은 대신(大神)의 거처인 『궁전』에서 열린다. 신들의 법률 『신법(神法)』에 따라 여러 문제를 논의하고 심판을 내리는 자리다. 그러나 『거짓과 악의를 꿰뚫어 보는 이능』을 지녔던 선대 대신이 세상을 떠난 뒤, 신계재판은 형식만 남게 되었다. 대신이 대를 이은 이래 신계재판에서 유죄를 선고받은 자는 한 명도 나오지 않았다. 애초에 불려 온 신이 악의를 품고 있는지조차 확인할 방법이 없다. 누군가를 유죄로 심판하는 일은 불가능한 것이다. 그 결과 신계재판이 유명무실해져 간 것도 당연한 일이었으리라. 그런 신계재판에 올해도 일곱 신이 모였다. 그런데 이번 재판에는 수많은 『의혹』이 있다. 신법을 어긴 자, 신을 사칭하는 자, 신을 죽인 자──── 심판받아야 할 자를 정하기 위해. 신계의 질서를 지키기 위해. 오늘 밤, 수백 년 만에 『신계재판』이 그 역할을 다한다.

이 세상에는 ‘공간 기억’을 읽어내는 특수한 인간이 있다. 그 힘을 사용하는 것은 법률로 금지되어 있는 가운데, 정부에게 그 힘을 사용하는 것을 인정받은 자들을 — 심층 기억 탐정이라고 불렀다. 그 직업에 종사하는 4명의 탐정들은, 어떤 사건 해결을 위해 소집되었다. 【대부호 시로가네 타다시 살인사건】. 사건 당시, 시로가네 타다시가 살해된 저택에 있던 인물은 3명. 용의자 후보들은 이미 구류되어 있으며, 범인은 특정되지 않았다. 4명의 심층 기억 탐정은 정부로부터 명령받는다 — 시로가네 타다시 살인의 범인을 찾아내라.

공간에는 기억이 남는다 — 3차원과는 다른 영역에 떠도는 정보 입자 ‘심층 입자’는, 공간의 기억 그 자체. 그 입자를 지각하려면 타고난 특이한 힘이 필수다. 그 인간을 심층 입자 감수자라 불렀다. 그들은 특이한 존재이기에 정부의 감시하에 놓이거나, 혹은 정부 공인의 어떤 직업에 종사하게 된다. 직업의 이름은 ‘심층 기억 탐정’ — 그들 특수한 탐정은 정부의 명령에 의해 사건 현장을 방문해 해결한다. 오늘도 또, 오늘 아침 일찍 4명의 심층 기억 탐정들은 사건 현장을 방문했다. 피해자는 록 밴드 ‘Deep’의 매니저를 맡고 있던 남성. 4명의 심층 기억 탐정들은 정부로부터 명령받는다.

현재 시각은 23시 50분. 지금 막, 당신들은 인류 최초의 시간여행에 도전하려 하고 있다. 눈앞에 있는 거대한 게이트를 통과하면 과거로 시간을 거슬러 올라갈 수 있다. 약간의 긴장과 흥분을 억누르며, 당신들은 게이트를 향해 발을 내딛는다. ——과거로 거슬러 올라갔다. 그곳에서 당신들이 본 것은, 꿈쩍도 하지 않게 된 한 남자의 모습이었다.
세계적인 악인들의 성과를 가리는 [세계 악인 기구]. 오늘의 대상 수상자로 가장 유력한 악인들이 각기 자신의 업적을 자랑하고 있다. 세계 최고의 악인을 수상하는 이번 시상식에서 갑작스레 불이 꺼지며, 무대 위에 마이크를 든 사회자가 나와 개회식을 알렸다. [이번 시상식에선, 무려 세계적으로 칭송받고 있는 히어로 [H]살해에 성공했다던, 최고의 악인이 이 자리에 있습니다!!] 그러나, 누군가 사회자에게 조심스레 다가가 귓속말로 무언가를 속삭이더니, 이내 곧 시상식 무대에 거대한 화면이 비치며 [H]의 모습이 담긴, 영상이 재생되었다. [정말, 고마워! 이번에는 진짜로 죽을 뻔했어. 당신 아니었다면 이번에는 빠져나오기 힘들었을거야. 그럼, 약속 장소에서 보자고!] 누가 죽였는가가 아닌, 누가 살려주었는가! 우리들 중 누군가 [H]의 생존을 도운 자가 있다! 머더 미스터리가 아닌, 세이프! 미스터리! 개봉 박!두!

「당신이 쓴 게임 시나리오 속 사건에, 짚이는 데가 있습니다.」 게임 시나리오 작가인 칸다에게, 어느 여성으로부터 한 통의 메일이 도착했다. 발신인은 칸다가 쓴 시나리오 속에서 일어나는 사건에 짚이는 데가 있다고 말하지만, 그 사건은 현실의 사건을 바탕으로 만든 것이 아니라 완전히 칸다의 창작이었다. 그러나 그녀는, 「저는 이 사건에 크게 관여한 인물일지도 모릅니다」라고 답했다. 칸다는 흥미 본위로 그 이상한 메일의 발신인과 통화를 하기로 했는데…
문제를 풀지 못한다면 죽습니다. 섬 에덴으로 초대된 5명의 인물, 한 밤중 일어난 이유 모를 사건에서 살아남을 수 있을까?
「오르피니아 대륙 횡단 퍼레이드」 개최를 앞두고, 네 나라가 준비를 진행하고 있었다. 퍼레이드 전날, 최종 확인을 위해 각국에서 2명씩 대표자가 모인다. 그리고 그곳에서, 살인 사건이 일어났다. ──모두가 퍼레이드의 성공을 위해 모였을 터였다. 퍼레이드의 주역인 「영웅의 상」을 보기 위해, 사람들은 내일을 기다리고 있다.