지구 저궤도 위에 건설된, 전 인류의 지식을 축적하는 차세대형 아카이브 시설. 통칭 ‘The SKY-LIBRARY(스카이 라이브러리)’. 평소에는 한정된 인원만 머물지만, 보수 점검을 위해 정기적으로 인원이 파견된다. 지구에서 파견된 전문 스태프가 탑승한 어느 날, 사서장인 카엘룸이 숨진 채 발견되었다. 사고인가, 살인인가―― 그리고 데이터베이스의 ‘금지 구역’에는 누군가 침입한 흔적이 남아 있었다.

2154년, 댄 브레스턴이 유해한 우주 방사선으로부터 인체를 보호하는 금속 아스타륨을 발견하고 그 생산을 시작했다. 이를 계기로 우주 개척은 크게 가속되었고, 부유층 일부는 우주로 이주하기 시작했다. 그 후 댄은 우주 호텔 ‘엘리시움’을 건설해 우주여행을 더 많은 사람들에게 널리 퍼뜨렸다. 어느 날, 엘리시움 관내에 무기질적인 인공 음성이 울려 퍼진다. “실내 수영장에서 비상 버튼이 눌렸습니다. 즉시 현장을 확인하십시오.” 모여든 엘리시움 관계자 4명과 숙박객 2명, 총 6명은 그곳에서 두 구의 시체를 발견한다.

이곳은 어느 우주선. 다섯 명의 크루가 탑승한 이 배는 고향 행성으로 귀환하는 중이다. 멀고 긴 여행 속에서 그들은 서로를 신뢰하며 강한 유대로 맺어져 있었다. 그런 여행도 이제 돌아가기만 하면 된다……. 고향에 대한 그리움과 한 가닥 아쉬움 속에서 마음이 일렁이고 있었다. 그러던 어느 날, 평소와 다름없는 태스크를 하고 있었을 터인데……. 누구인지 알 수 없는 새카맣게 탄 시체와, 크루 중 한 명이 혼수상태로 발견된다. 과연 평화롭던 배에서 무슨 일이 벌어지고 있는 걸까.

인적이 드문 산속 깊은 곳에 있는 로봇 연구소. 그곳에서는 박사와 다섯 대의 로봇이 함께 살고 있었다. 하지만 어느 날 밤, 박사가 시체로 발견되었다. 용의자는 남겨진 로봇 다섯 대. 이 안에 박사를 죽인 ‘살인기’가 있다. 다음 날 아침이면 경찰이 들이닥친다. 그때까지 범인을 찾아내 기능을 정지시켜야 한다. 그러지 못한다면, 그래, 전원 모조리 고철이 될 뿐이다…….

2025년, 일본은 악의 조직 ‘고쿠아크’의 위협에 노출되어 있었다. 고쿠아크는 특수 능력을 지닌 괴인을 잇달아 만들어 내 일본 각지로 보내고 있었다. 경찰이 괴인에 맞서고 있었지만, 괴인은 특수 능력을 가진 강화 인간이었다. 통상 무기로는 괴인들을 당해 낼 수 없다. 강도, 살인, 테러 행위… 나날이 악화되는 치안에 일본 전체가 절망에 휩싸여 있었다. 그런 가운데, 한 줄기 희망이 나타난다. 희망의 빛, 저스티스맨의 등장 빨간 타이츠를 몸에 두른 수수께끼의 히어로 ‘저스티스맨’이 갑자기 나타난 것이다! 그는 괴인들을 차례차례 쓰러뜨리며 사람들에게 희망을 가져다주었다. 일본 정부는 곧바로 그 히어로를 지원하기 위해 특수한 기능을 지닌 멤버를 모아 경찰청에 ‘히어로 특무과’를 설립. 어느 날, 괴인 조직 고쿠아크가 저스티스맨의 변신 방법을 해석해 냈다는 소문이 돈다. 본작의 플레이어 캐릭터인 히어로 특무과 직원 4명과 저스티스맨은 저스티스맨의 변신 방법을 연구하고 있다는 무인도의 연구소로 자료를 파기하러 향했던 것이었다…

오늘은 예전에 떠나보냈던 안드로이드들이 ‘학습’을 마치고 그의 연구소로 돌아오는 날. ……그의 집념이 결실을 맺는, 기념할 만한 하루가 될 터였다. “우리는 그림 님이 죽음에 이른 진상을 밝혀내야 합니다.” 우리는 이해하고 있었다. ‘그림 갤럭시’가 이제 영원히 돌아오지 못할 여행을 떠났다는 것을. 그리고 우리가 각자 행동해야 한다는 것을. “자, 논의를 시작합시다. ───왜냐하면, 우리는 Parody people이니까요.”

아주 먼 미래…… 혹은, 그보다 더 먼 과거의 일――― 우주에는 수많은 행성이 있고, 그 하나하나에 다양한 생명이 살고 있다. 최첨단 기술을 보유한 지구를 중심으로 우주에서는 활발한 성간 교류가 이루어졌고, 행성 사이에는 풍요로운 경제 사회가 구축되어 있었다. ……그러나 그 부를 노리고 범죄 행위에 나서는 자들―――우주 해적이 대두하기 시작한다. 이를 각 행성이 용납할 리 없었고, 지구 정부를 중심으로 엄격한 단속을 벌이고 있었다. 그리고 바로 지금도 두 척의 우주선이 추격전을 벌이고 있다. 한 척은 칠흑의 우주 해적선 ‘바하무트’, 다른 한 척은 순백의 우주 전함 ‘리바이어선’이다. 교착 상태의 스페이스 체이스 도중, 갑자기 거대 생물 ‘스페이스 크라켄’이 모습을 드러냈다. 난입자의 강습으로 두 우주선은 근처 행성에 불시착하고 만다. 불시착한 행성을 탈출하기 위해 일시 휴전을 맺는 우주 해적과 우주 해군 일행. 손상이 적은 ‘바하무트’를 수리해 탈출을 노리지만…… 행성에 비명이 울려 퍼진다. 모두가 그 목소리가 난 곳으로 모이자…… 우주 해군 소속 ‘선의’가 피 웅덩이 속에서 발견되었다. 이것은 우주를 누비는 네 명의 우주 해적과 네 명의 우주 해군의 이야기.

인공적으로 만들어진, 인간이 아닌 힘을 이용해 범죄 행위를 저지르는 개조 인간. 아무도 모르게 사회의 뒤편에서 활개 치는 악의 조직에서, 그 개조 인간들을 만들어 온 박사가 살해당했다. ――그것은 개조 인간의 반역인가? ――아니면 잠입한 인간 이능력자의 소행인가? 진실을 밝히기 위해…… 개조 인간들은 범인 찾기를 시작한다. 서로의 목적을 이루기 위해, 마음속에 칼날을 숨긴 채.

플라스틱 피부, 화학 합성된 식품, 기름과 연기에 휩싸인 폐기물 냄새가 감도는 가운데, 누구나 자신의 이익을 좇으며 살아가는 자유의 도시. 살인 사건의 용의자로 모인 6명. 옆에 앉은 자는 과연 자신에게 이익을 가져다줄 자인가, 아니면――. ‘브라이트 테크 사’가 지배하는 도시, 뉴 유토피아. 사람들은 다양한 의수와 의족, 임플란트를 몸에 달고, 화학 합성된 식품을 먹으며 살아간다. 어느 날, 불법 임플란트와 약물을 거래하던 브로커가 자신의 공방에서 살해된 채 발견되었다. 용의자로서 ‘브라이트 테크 사’에 모인 것은 청소부, 개발자, 브로커, 의사, 보조기 기사, 학생. 회의가 끝날 때까지 범인을 찾아내야 한다. 이 회의에 참가한 당신은 느낄 것이다. 다양한 인간의, 다양한 속셈이 교차하고 있음을――.

런던의 한 주택가에서 의문의 화재가 발생했다. 화재로 인해 집주인 ‘제임슨’은 목숨을 잃었고, 불길 속에서 가까스로 구조된 그의 아들 ‘아서’는 혼수상태에 빠져 깨어나지 못했다. 경찰측은 마침 개발 중이던 장비를 최초로 시범 적용하기로 결정했다. 그것은 바로 타인의 기억 속으로 직접 들어갈 수 있는 장치였다. 수사국은 런던에서 활동하는 탐정들을 모두 소집한 후, 그들을 아서의 병실로 불렀다. 기기를 착용한 탐정들은 사건의 진범을 찾기 위해 아서의 기억 속으로 들어갔다.