새들의 지저귐이 들린다. 이따금 나무들이 흔들리면 햇살이 새어 들어와, 우거진 풀꽃에 따스함을 더한다. 바다 내음이 코끝을 간지럽힌다. 고지대 안쪽에는 바다가 있는 모양이다. 이 일대는 어느 연구실을 위해 마련된 연구 시설. 자연이 풍부한 곳에 어울리지 않는 커다란 연구실이 부지 한가운데 우뚝 서 있다. 그곳에서는 매일같이 실험이 이루어지고, 매일같이 폭발 사고가 일어난다. 오늘도 구름 한 점 없는 하늘로, 반쯤 무너진 연구실에서 검은 연기가 피어오르는 듯하다. 그것은 따스한 날씨와 어우러져, 여느 때와 다름없는 평범한 일상을 연출하고 있었다. 이것은, 어느 하루의 이야기.

서기 20XX년 일본 어느 날, 초인적인 힘을 가진 인간이 남몰래 탄생한다. 아키라(靖)라 이름 붙여진 그는 자신과 같은 초능력을 가진 동료들을 모아 하나의 조직을 만든다. 자연적·인위적 대재해 등을 미리 막는 등, 겉으로 드러나지 않게 사람들을 돕고는 떠나간다. 그런 히어로 같은 조직 「psicle(사이클)」이 실재하고 있었다. 어느 날 밤, 아키라 단장의 전달에 따라 본부에 모인 단원 5명. 그의 지시 아래, 모두는 나뉘어 그들의 거점인 본부 안을 둘러본다. 약 1시간 후, 아키라가 누군가에게 살해된 현장을 모두가 발견한다. 범인은 아마 이 안에 있을 것이다. 의심에 사로잡힌 그들에게 설상가상으로, 바깥에는 엄청난 폭우와 바람이 몰아치고 있다.