“──이것은 우리가 하늘에 바치는, 작은 기도의 이야기” 당신들은 세이카 시립 세이카 고등학교에 다니며, ‘시라유리 치사토’가 설립한 동아리 ‘역사연구부’에 소속되어 있다. 11월 말, 전교 조회가 끝나고 여느 때처럼 동아리실로 향하는 일행. 하지만 그 안에 치사토는 없었다. 그들이 다음으로 치사토를 목격한 것은, 동아리실 바닥에 붉은 피의 꽃을 피우고 그 속에서 숨이 끊어진 그녀의 모습이었다. 성격도 좋고 문무를 겸비해 교내에서도 유달리 인기가 많았다. 어째서 그녀가. 남겨진 네 사람은 치사토에게 많은 신세를 졌다. “이 사건, 우리 손으로 범인을 밝혀내고 진상에 다다르고 싶다.” 네 사람은 세상을 떠난 치사토에게 그렇게 다짐한다.