어느 날, 세계는 마왕의 공포에 지배당했다. 세상에 만연한 흉악한 마물과 그들을 이끄는 마왕에 맞서기 위해, 베르스 왕국의 왕은 마왕을 쓰러뜨릴 용감한 자를 모집했다. 시간이 흘러, 수많은 시련을 극복하고 여신의 축복을 얻은 용사는 드디어 마왕을 쓰러뜨리기 위해 긴 여정을 떠나려 하고 있었다. 여행 전날 밤, 용사를 배웅하기 위한 식이 열렸다. 식은 성대하게 치러졌고, 용사는 국왕으로부터 정식으로 용사의 칭호를 받았다. 세상의 희망이 한데 모이고, 사람들의 눈에 빛이 돌아온 밤이었다. 사건은 다음 날 이른 아침에 일어났다. 왕을 부르러 간 공주가 비명을 지른 것이다. 공주가 본 것은 머리가 통째로 사라진 처참한 모습으로 죽은 왕의 모습이었다. 이를 알아챈 기사가 다른 사람들을 불러 모았다. 모인 인물은 다섯 명. 발견자인 공주, 왕의 방을 경비하던 기사, 그리고 이 성에 묵고 있던 용사와 그 동료인 전사와 승려. 성은 삼엄하게 경비되고 있었고, 어젯밤부터 지금까지 드나든 사람은 없었다. 왕을 죽인 범인은 이 안에 있다. 다섯 사람이 그렇게 생각하는 것은 자연스러운 일이었다. 대체 누가 무슨 목적으로 국왕을 살해했는가. 왕의 목숨을 둘러싼 이야기가 막을 연다.

이곳은 한정된 사람만 입학할 수 있는 학교, 브레인 고등학교. 그중에서도 특히 우수한 학생들만 모인 곳, 그것이 A반이다. 브레인 고등학교 안에서도 특히 엄격한 이 반을 졸업하면, 그 후 무엇이든 자유롭게 할 수 있을 만큼 장래가 보장된다고 한다. 물론 A반에는 한정된 인원만 들어갈 수 있어, A반 학생은 단 5명뿐이다. 스포츠의 천재, 축구부. 문학의 천재, 축구부 매니저. 수학의 천재, 미술부. 선도의 천재, 학생회장. 그리고 모든 것이 완벽한 문무양도의 천재, 귀가부. 저마다 천부적인 재능을 지녔으며, 브레인 고등학교의 모든 학생이 동경하는 인물들이다. 그런 A반 학생들이 여느 때처럼 혹독한 수업을 받고, 여느 때처럼 학교생활을 보내던 어느 날 방과 후, 사건이 일어났다. 교실에서 담임이 죽어 있는 것이다. 대체 누가...? 긴장감이 감도는 가운데, 천재 다섯 명의 추리가 지금 시작된다——