이 세계에는 육감이 뛰어난 인간이 존재한다. 아주 조금 앞의 미래를 감지해 위기를 구한다. 위대한 그들을 기리듯 ‘예언자’라 부르게 되었다. 짙은 안개에 휩싸인 숲 깊은 곳, 조용히 자리한 오두막 한 채에 아마릴리스라 불리는 인물이 홀로 살고 있었다. 그곳에 모인 네 명의 예언자에게 묻는다. “그럼, 들려줄래? 내 미래에 대해서.” 예언자들의 대답은 저마다 달랐지만, 딱 한 가지 공통점이 있었다. 머지않아 아마릴리스가 죽는다. “뭐, 거짓말이지? 넷 다 내가 죽을 거라고 생각하는 거야!?” 얼마 지나지 않아, 발견된 것은 당연히── 움직이지 않게 된, 시체 하나.

어느 지방의 산속에 조용히 버려진 빈집 한 채. 평소에는 사람이 찾지 않는 그 건물 앞에, 이날은 다섯 개의 사람 그림자가 있었다. 산을 찾은 이유는 저마다 달랐지만, 이상하게도 모두가 입을 모아 “걷고 있는데 갑자기 안개가 끼더니, 헤매는 사이 이 건물 앞에 도착해 있었다”고 한다. 산을 뒤덮은 안개는 여전히 짙어지고 있어, 도저히 곧바로 하산할 수 있는 상황이 아니다. 모인 사람들은 어쩔 수 없이, 안개가 걷힐 때까지 이 빈집 안에서 몸을 쉬기로 했다―――

‘마나’를 먹음으로써 먹이사슬에서 벗어나 문명을 쌓아 올린 옛 육식동물과 옛 초식동물들. 그러나 종족 간의 갈등은 남아 있어, 서로를 구별하며 살아가고 있었다. 극동의 섬나라 수도에 있는 ‘수도 고교 케모노 도쿄’는 옛 육식동물만 다니는 학교. 그곳에 입학한 최초의 옛 초식동물―― 수컷 염소 류트는 두 종족 간 융화의 상징이었다. 그러나 어느 날 아침, 류트는 교실에서 시체로 발견된다. 용의자는 넷―― 암컷 늑대 아냐, 수컷 호랑이 개러스, 수컷 표범 훔볼트, 암컷 양 메이. 과연 누가 류트를 죽였을까?

도대회 우승, 간토대회 준우승, 전국대회 베스트 16의 기록을 가진 강호교, 효테이 학원 테니스부. 오늘은 정기시험 전이라 정규 레귤러와 매니저 5명만이 강화 훈련을 하고 있었다. 평소와 다름없는 훈련이었을 터였지만, 한 가지 큰 차이가 있었다. 저녁 무렵, 트레이닝룸에서 매니저장 유즈가 머리를 맞은 상태로 발견된 것이다. 맥박은 이미 없다. 아무래도 흉기는 덤벨인 것 같다. 정규 레귤러들은 훈련 중 대부분의 시간을 운동장에 있었기 때문에, 만약 내부의 범행이라면 부실을 자주 드나들던 매니저진의 범행일 가능성이 높다. 동기도 있다. 다섯 명은 아토베 님의 암고양이들로, 평소 아토베 님과 접촉할 기회를 서로 빼앗으며 으르렁대고 있다. 이 사실은 효테이 학원 학생이라면 누구나 알고 있었다. “말해도 좋다.” 사카키 감독이 그렇게 지시하자, 매니저진은 경찰이 올 때까지 스스로 오늘의 일정을 되짚어 보기로 했다…….

숲속에 집 한 채가 있었다. 그곳에서는 한 소녀가 봉제 인형들과 함께 살고 있었다. 봉제 인형들은 소녀의 마법으로 생명을 얻어 움직이는 인형이 되어 있었다. 그래서 봉제 인형들은 그녀를 마스터라고 부른다. 어느 날 저녁, 마스터가 누군가에게 살해당하고 말았다. 이런 숲속 저택에서 살인을 저지를 수 있는 건 네 마리 봉제 인형 중 누군가임이 틀림없다. 대체 마스터를 죽인 범인은 누구인가.

이곳은 깊은 산속에 있는 작은 진료소. 명의라 불리던 원장이 조용히 운영하는 그 진료소에는, 저마다 사정을 안고 있는 아이들이 입원해 있었다. 어느 날 밤, 네 사람은 옆의 폐병원으로 담력 시험을 하러 가게 되었다. 캄캄한 병원의 한 방에서 희미하게 빛이 새어 나오고 있다. 그곳에 있던 것은, 죽었을 터인 친구 미도리였다――.

……카가미 앨리스는 완벽한 사람이었다. 카가미 앨리스는 문무를 겸비했고, 단정한 용모와 천진난만한 성격 덕분에 다른 학생들에게도 인기가 높아 학원의 얼굴이라고까지 불리는 인물이었다. 학원의 모두가 카가미 앨리스를 사랑했다. 그리고……카가미 앨리스는 죽었다. 그녀는 학원 안 계단참에 피어난 핏물 위에서 조용히 움직이지 않게 되어 있었다.

두 번째 스위치백에서, 죽은 사람의 방에서 호출이 울렸다. 고개를 넘는 침대열차 ‘야상’의 마지막 밤. 23시 45분, 열차가 니노사와 신호장에 멈췄을 때 사장의 방에서 차장에게 호출이 들어왔다. 달려간 차장이 본 것은 바닥에 쓰러진 사장이었다. “0시에 라운지에서 중요한 이야기를 하겠다”고 말했던 사장은 0시를 기다리지 못하고 죽었다. 눈으로 길이 막힌 종착역에서 열차는 아침을 기다린다. 범인은 당신들 네 사람 중에 있다.

현대 일본, 어느 지방 도시 변두리에 있는 저택에서 살인 사건이 일어났다. 6월 15일, 지주인 야마노 호토케가 시체로 발견된 것이다. 현장이 된 저택에는 가족밖에 없어 용의자는 좁혀져 있었지만, 증언이 서로 맞지 않고 가족들이 가택 수색에 비협조적이었던 탓에 경찰 수사는 진전이 없어, 7월 15일 현재까지도 수사 중이다. 그런 야마노 가문의 식탁에서 한 가족이 ‘수수께끼 풀이 게임’을 제안했고, 가족끼리의 추리가 시작되었다.