정체불명의 시설에서 눈을 뜬 네 명의 AI. 그들은 자신들이 왜 만들어졌는지, 그 이유를 조사하기 시작한다.

지구력 2873년. 테라포밍 기술의 발전으로 인해 인류의 거주지는 태양계를 넘어 확장되었고, 인류는 수십 개의 별에 흩어져 살아가고 있었다. 정착 초기에는 자원을 둘러싼 다툼이 끊이지 않았으나, 각 별의 유력자들이 모여 "인류총회의"를 설립하고 각 지역의 전쟁을 평정하였다. 현재는 반란 행동도 극소수에 불과하다. 그 해 겨울, 쌍둥이자리 유성우를 관측하던 천문대가 유성우 속에서 하나의 메시지를 발견한다. "휴먼 여러분, 안녕하세요. 저희 별로 와주세요." 외우주의 지적 생명체로부터 온 것으로 보이는 메시지에 사람들은 크게 들떴다. 인류총회의는 즉시 외우주 탐사 계획 《프로젝트 제미니》를 발족하고, 메시지에 표시된 좌표로 우주선 제미니호를 보내기로 결정했다. 제미니호는 콜드슬립 상태의 승객들과 5명의 승무원을 태우고 목적지를 향해 여정을 계속한다. 그러나 평온한 일상은 선내에 울려 퍼진 비명소리로 인해 산산이 부서졌다. 급히 달려간 승무원이 발견한 것은, 등 뒤에 단검이 꽂힌 채 죽어 있는 선장의 시체였다. 선장은 왜 죽었는가? 의혹이 휘몰아치는 제미니호의 미래는 어떻게 될 것인가? 그 우주선은, 희망과 악의를 동등하게 싣고 나아간다.

우주력 20XX년. 1년에 걸친 임무를 끝내고, 우주선 샹데호는 귀환길에 올랐다. 평소와 달리 선내에는 화기애애한 분위기가 감돌았고, 로비에 모인 이들은 고향 이야기를 꽃피우고 있었다. 그때였다. 충돌음과 함께 기체에 무언가가 부딪혔다. 밖으로 나가 확인해보니, 외부 해치 근처에 운석 모양의 이생물이 박혀 있었다……. ──2시간 후. 이생물을 채취했던 선장 라우라가, 선장실에서 피를 흘린 채 숨져 있는 것이 발견된다. 라우라는 왜 죽은 것인가. 선원들은 사건의 전모를 조사하기 시작한다.

시기는 서력 31XX년, 봄. 우리는 어느 식물 연구소의 콜드슬립 캡슐에서 깨어났다. 망가진 조명, 금이 간 복도. 녹슬어 무거워진 문에 보안 잠금 불빛이 비춘다. 우리에게는 기억이 없다. 방 구석에는 말라버린 시신이 한 구. 닫힌 대정원에는 오늘도 수많은 풀꽃들이 만발해 있다.

국내 최대의 VR 가상 현실 플랫폼, 그 안에서도 선별된 인원만 들어올 수 있는 비밀스러운 친목 서버. 서버의 주인이자 금발 귀공자 네오, 언제나 분위기를 띄우는 바나나맨, 3미터 거구의 메카닉 맥스, 고양이 수인 카티야, 그리고 모두의 사랑을 받는 탑티어 버튜버 루나. 서로 아바타로 마주해 온 5명의 주 멤버들은 오늘도 평화롭게 교류하고 있었다. 그 순간, 고막을 찢는 시스템 경고음과 함께 사방의 월드가 벽돌처럼 단단히 굳어버린다. [경고. 본 월드의 관리자(방장) '네오' 유저의 실제 사망이 확인되었습니다. 화면의 로그아웃 버튼이 비활성화됩니다.] "네오가... 죽었다고? 게다가 로그아웃이 안 돼?!" 완벽한 고립. 그리고 밀려오는 끔찍한 의심. 방장인 네오를 가상 현실 시스템 너머 현실에서 살해한 진범은, 지금 이 닫힌 서버 안에서 아바타의 가면을 쓴 채 함께 당황하고 있는 크루원 중 한 명이다. 서로의 추악한 현실 본모습을 파헤치고 네오를 죽인 범인을 찾아내야만 한다. 복잡하게 얽힌 거짓말 뒤에 가려진, 누구도 예상치 못한 진짜 진실을 밝혀내라.

2032년, 지구. 제3차 세계대전의 위기와 바이러스 감염 폭발을 가까스로 넘긴 각국 정상들은 ‘원 어스(하나의 지구)’를 슬로건으로 내걸고, 새로운 자원 확보를 위한 국제 우주개발 조직을 출범시켰다. 일본 쓰쿠바에 세워진 최신 우주개발연구소에는 여러 나라에서 온 우수한 과학자와 기술자들이 모여 있었다. 연구소가 설립 2주년을 맞이하기 직전의 어느 밤, 부지 내 시험동에서 비정상적인 방사선량을 알리는 경보가 울렸다. 직원들이 서둘러 옥외로 일시 대피한 직후, 다른 실험동에서 대규모 폭발이 발생한다. 도대체 무슨 일이 일어난 것일까? 방사선 전문 직원이 주변 공기 정화를 마친 뒤 폭발 현장을 확인하러 갔을 때, 멀리서도 단번에 알 수 있었다――폭심지로 보이는 방 한가운데에 한 남자가 쓰러져 있었다. 당신들의 상사이자 이 연구소의 소장이다. 그는 연구소가 심혈을 기울여 온 최신 대형 실험장치 옆에서 숨을 거둔 채였고, 온몸은 폭발로 인해 심하게 불에 타 있었다.

2231년, 인류는 육체의 상당 부분을 기계로 대체할 수 있게 되었다. 팔을 잃으면 의수를, 심장을 잃으면 인공 장기를, 뇌의 일부를 잃으면 신경 칩을 이식한다. 그렇다면 몸의 모든 부위를 하나씩 교체한 뒤에도, 우리는 그 사람을 여전히 같은 사람이라고 부를 수 있을까? 이틀 전, 세계적인 인공지능 연구자 아담 레이너가 자신의 연구실에서 숨진 채 발견된다. 경찰은 즉시 수사에 착수하지만, 다음 날 한 의체가 경찰서를 찾아와 자신이 아담 레이너라고 주장한다. 그는 육체는 죽었지만 자신의 의식은 여전히 존재하며, 따라서 자신의 죽음을 둘러싼 수사는 필요 없다고 말한다. 결국 사건은 특수존재범죄수사국(SEID)으로 이관되고, 수사관 이브 서와 카인 진이 조사를 맡게 된다. 그러나 수사가 진행될수록 그들이 마주하는 것은 단순한 사망 사건이 아니었다. 육체와 의식, 기억과 자아. 인간을 인간답게 만드는 것은 과연 무엇인가. 그리고 아담 레이너를 죽인 사람은 누구인가.

수많은 과학기술들의 급진적인 발달로 부착용 기계가 담배처럼 팔리고 다른 행성을 탐사하는게 아르바이트 수준인 지구 통합도시 얼터스. 이 도시의 통신과 사이버 보안을 책임지는 '매지션'이 아지트에서 처참하게 부숴진 채 발견된다. 용의자는 리더로부터 비상 연락을 받고 아지트에 도착한 팀원 5인. 모두가 현장에 도착한 순간 문이 잠기고, 스크린에 매지션의 모습이 흘러나온다. 현장의 증거와 용의자들의 관계를 알아내, 매지션을 살해한 진범을 찾아내자. 그리고..

어느 날부터인지, 이유도 모른 채 초자연적인 능력을 가진 사람들이 하나둘 나타나기 시작했다. 사람들은 그들을 변칙자라 불렀다. 변칙자들을 관찰하고 연구하며, 그 능력이 인류의 삶을 더 나은 방향으로 이끌 수 있을지 찾기 위해 미래재단이 설립되었다. 하지만, 완벽한 통제란 존재하지 않았다. 제5연구소에서 한 변칙자가 탈출하는 사건이 일어났다. 그녀의 능력은「모방」이었다. 그리고 얼마 지나지 않아, 그 변칙자는 죽은 채로 발견되었다. 그 죽음 속에 숨겨진 진실은 무엇일까.

《에덴》 2XXX년 XX월 XX일. 인류는 사이보그로 진화 중에 있다. 프로젝트 명, [에덴] 세계적인 과학자 제페토 박사에 의해, 인류는 새로운 형태로 재탄생했다. 질병도, 노화도, 죽음조차 더 이상 존재하지 않는다. [죽음]이라는 개념은 이제, 단지 과거의 기록 속에만 남은 단어가 되었다. 인류를 만들어내는 공장— 사람들은 제페토의 연구소를 [휴먼 팩토리]라 불렀다. 이 모든 것은 오직 그의 천재적인 연구 아래에서만 가능했다. 그리고 지금, 전 인류의 사이보그화까지 단, 1%만이 남은 상태. 에덴의 완성까지, 단 60분. 그러나 그 순간— 제페토 박사는 자신의 연구실에서 시체로 발견된다. ⸻ 그날, 연구소에 있던 인물은 단 네 명. • 프로젝트를 전폭적으로 지원해 온 사업가, K • 연구소의 모든 것을 알고 있는 메이드, W • 제페토를 동경해 찾아온 연구생, J • 그리고 그의 연구에 가장 깊이 관여한 핵심 연구원, M K는 프로젝트의 완성을 축하하기 위해 하루 전 연구소를 방문했다. 하지만, 완성을 하루 앞둔 시점에서 제페토는 의문의 죽음을 맞이한다. ⸻ 아직 끝나지 않은 프로젝트. 그리고 이미 사이보그가 되어버린 인류. [사이보그 연구]의 최고 권위자 제페토 박사의 죽음이 세상에 알려진다면, 혼란은 피할 수 없다. 결국 네 사람은 결단을 내린다. [에덴이 완성되기 전까지, 제페토 박사의 죽음을 숨긴다.] 그리고— 진실은, 그들 스스로 밝혀내기로 한다.